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molecular biology

316 पेपर

📄 आणविक जीव विज्ञान

Deletion of the ribosomal protein gene rpmJ activates zntA transcription through a translation-dependent mechanism in Escherichia coli

*Escherichia coli* में राइबोसोमल प्रोटीन जीन *rpmJ* का विलोपन (deletion), मूल *zntA* प्रमोटर और N-टर्मिनल कोडिंग क्षेत्र से जुड़े एक अनुवाद-निर्भर (translation-dependent) तंत्र के माध्यम से *zntA* के ट्रांसक्रिप्शन को बढ़ाता है और जिंक प्रतिरोध प्रदान करता है, एक ऐसी प्रक्रिया जिसे RpmJ पैरालॉग YkgO की एक्टोपिक अभिव्यक्ति द्वारा उलट दिया जाता है।

Shirakawa, R., Ishikawa, K., Furuta, K., Kaito, C.2026-08-06
📄 आणविक जीव विज्ञान

Structural and functional insights into multiple BAM-bound conformations of BepA enabling substrate triage at the outer membrane

यह अध्ययन क्रायो-ईएम (cryo-EM) संरचनाओं और कार्यात्मक विश्लेषणों का उपयोग करता है ताकि यह प्रकट किया जा सके कि बेपा (BepA) के 6- और 9-लूप्स के विशिष्ट विन्यास संबंधी पुनर्गठन (conformational rearrangements) कैसे BAM कॉम्प्लेक्स पर LptD के ट्राइएज (triage) के दौरान सबस्ट्रेट इंटरेक्शन और प्रोटियोलिटिक एक्टिवेशन में इसकी दोहरी भूमिकाओं को नियंत्रित करते हैं।

Miyazaki, R., Kimoto, M., Kohga, H., Nishi, T., Sawasato, K., Takahashi, Y. S., Asai, S., Daimon, Y., Suzuki, T., Laksmi (…)2026-08-05
📄 आणविक जीव विज्ञान

FAM136A is an essential chaperone for mitochondrial membrane protein biogenesis

यह अध्ययन FAM136A को एक संरक्षित, आवश्यक चैपरोन के रूप में पहचानता है जो माइटोकॉन्ड्रियल इंटरमेम्ब्रेन स्पेस (intermembrane space) में स्थित होता है और वोल्टेज-डिपेंडेंट आयन चैनल्स (VDACs) तथा विशिष्ट इलेक्ट्रॉन ट्रांसपोर्ट चेन सबयूनिट्स को घुलनशील बनाने और बाहरी माइटोकॉन्ड्रियल झिल्ली में उनके सम्मिलन को सुगम बनाने का कार्य करता है।

Ernst, M., Zhang, J., Xu, H., Ma, A., Boegeholz, L. A. K., Szabo, M., Wang, T.-Y., Chou, T.-F., Guna, A., Voorhees, R. M (…)2026-08-04
📄 आणविक जीव विज्ञान

Genome-wide definition of the CosR regulon and DNA-binding properties in Campylobacter jejuni

यह अध्ययन *कैम्पिलोबैक्टर जेजुनी* में जीनोम-व्यापी CosR रेगुलोन को परिभाषित करने के लिए ChIP-seq और DNase I फुटप्रिंटिंग का उपयोग करता है, जो इसके द्विभाजित (बाइपार्टाइट) DNA-बाइंडिंग मोटिफ, ऑटोरेगुलेशन और ऑक्सीडेटिव तनाव के तहत मुख्य कोशिकीय प्रक्रियाओं के रेडॉक्स-उत्तरदायी पुनर्गठन को प्रकट करता है।

Chiti, E., Odorici, T., Noszka, M., Muraszko, J., Zannoni, A., Anna Zawilak-Pawlik, A., Vannini, A., Roncarati, D.2026-08-04
📄 आणविक जीव विज्ञान

A modular lentiviral system for multiplexed gene perturbation and functional analysis suggests interdependence of hormone receptors in breast cancer growth in vivo

यह अध्ययन एक बहुमुखी, मॉड्यूलर लेंटिविरल सिस्टम पेश करता है जो मल्टीप्लेक्स जीन परिवर्तनों और वास्तविक समय में फेनोटाइपिक निगरानी को सक्षम बनाता है, जो इन विवो स्तन कैंसर मॉडलों के माध्यम से यह प्रदर्शित करता है कि ER+ ट्यूमर की वृद्धि एस्ट्रोजन, प्रोजेस्टेरोन और एंड्रोजन रिसेप्टर्स की परस्पर निर्भर गतिविधि पर निर्भर करती है।

Alam, S., Matvienko, D., Boström, J., Pires, M. J., Papadimitropoulou, A., Eshtad, S., Sanjiv, K., Qian, H., Valerie, N (…)2026-08-03
📄 आणविक जीव विज्ञान

Molecular factors shaping small RNA content in mouse sperm

यह अध्ययन माउस शुक्राणु में छोटे आरएनए (small RNAs) की चयनात्मक, प्रोटीन-संबद्ध और कैपैसिटेशन-उत्तरदायी गतिशीलता को चित्रित करने के लिए अद्वितीय आणविक पहचानकर्ताओं (unique molecular identifiers) और स्पाइक-इन्स (spike-ins) का उपयोग करता है, जिससे तकनीकी पूर्वाग्रहों को सुलझाया जा सके और उन आणविक कारकों को स्पष्ट किया जा सके जो शुक्राणु के छोटे आरएनए संग्रह को आकार देते हैं।

Wu, P.-H., Perillo, G., Allen, G. E., Shehzada, S., Shibata, K., Ueberheide, B., Conzelmann-Prin, S., Darques, M. V., Sh (…)2026-07-31
📄 आणविक जीव विज्ञान

Branched C7-Substituted 7-Deaza-SAH Analogues Occupy the Entire SAM-Binding Pocket of Mpox Virus VP39 and Dengue Virus NS5 Methyltransferases

संरचना-निर्देशित डिजाइन के माध्यम से, शोधकर्ताओं ने शक्तिशाली शाखित C7-प्रतिस्थापित 7-डीज़ा-SAH एनालॉग विकसित किए जो mpox वायरस VP39 और डेंगू वायरस NS5 मिथाइलट्रांसफेरेज़ के संपूर्ण SAM-बाइंडिंग पॉकेट को घेरते हैं, जो संरचनात्मक रूप से भिन्न वायरल एंजाइमों को बाधित करने के लिए एक बहुमुखी रणनीति प्रदर्शित करते हैं।

Stefek, M., Klima, M., Otava, T., Chalupska, D., Dejmek, M., Nencka, R., Boura, E.2026-07-30
📄 आणविक जीव विज्ञान

Structure-free, site-resolved contrastive learningextends small-molecule discovery beyond the reachof structure-based modeling

यह शोध पत्र Ptarmigan-1 को प्रस्तुत करता है, जो एक स्ट्रक्चर-फ्री (संरचना-मुक्त), साइट-रिजॉल्व्ड (स्थल-विशिष्ट) कंट्रास्टिव लर्निंग मॉडल है, जो स्पष्ट 3D पोज़ निर्माण की आवश्यकता के बिना सीधे प्रोटीन अनुक्रमों और 2D रासायनिक संरचनाओं को एम्बेड करके विविध प्रोटीन लक्ष्यों—जिसमें क्रिप्टिक (गुप्त) और डिसऑर्डर्ड (अव्यवस्थित) साइट्स भी शामिल हैं—के माध्यम से तीव्र और सटीक वर्चुअल स्क्रीनिंग सक्षम बनाता है।

Fondrie, W. E., Canzani, D., Tatka, L., Paez, J. S., Prymolenna, A., Gutierrez, A., Robbins, J., McEllin, B., Hubbard, E (…)2026-07-30
📄 आणविक जीव विज्ञान

Aquatic bacterial metabolic rates from RNA quantitative stable isotope probing (RNA-qSIP) depend on experimental design

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि प्रयोगात्मक डिजाइन कारक, विशेष रूप से बायोरिएक्टर प्रकार और कार्बन सबस्ट्रेट जटिलता, आरएनए क्वांटिटेटिव स्टेबल आइसोटोप प्रोबिंग (qSIP) से प्राप्त जलीय जीवाणु चयापचय दर अनुमानों को महत्वपूर्ण रूप से प्रभावित करते हैं, जिससे जलीय वातावरण में इस विधि के भविष्य के अनुप्रयोगों के लिए महत्वपूर्ण मार्गदर्शन प्राप्त होता है।

Ahern, O., Bulseco, A., Smith, A., Weissman, J., Vallino, J. J., Huber, J. A.2026-07-29
📄 आणविक जीव विज्ञान

Structural and mechanistic insights into translation initiation on the enterovirus Type 1 IRES

यह अध्ययन पोलिओवायरस IRES पर ट्रांसलेशन इनीशिएशन (अनुवाद प्रारंभ) के संरचनात्मक और यांत्रिक आधार को प्रकट करने के लिए क्रायो-इलेक्ट्रॉन माइक्रोस्कोपी का उपयोग करता है, जो IRES डोमेन IVc और राइबोसोमल प्रोटीन uS19/uS13 के बीच महत्वपूर्ण अंतःक्रियाओं, साथ ही एक संरक्षित GNRA टेट्रालूप की पहचान करता है जो इनीशिएटर tRNA के साथ जुड़ता है, जो वायरल प्रतिकृति के लिए आवश्यक हैं।

Aracena-Velazquez, M., Nuthalapati, S. S., Hankinson, J., Fominykh, K., Lulla, V., Sweeney, T. R., Hill, C. H.2026-07-28